Los padres de este ilustre fueron Juan José Duarte Rodríguez y Manuela Diez Jiménez. José Juan Duarte nació en un pueblo de Andalucía y cuando joven migró a Santo Domingo.

Fundador de la sociedad La Trinitaria y principal ideólogo de la independencia, por dos veces vio Juan Pablo Duarte triunfar la causa por la que luchó toda su vida: en 1844, cuando el país logró la independencia de Haití, y en 1865, cuando, tras la anexión española, se restauró la República Dominicana.